两种酵母单杂交系统的比较

两种酵母单杂系统比较
系统 Y1HGold系统 Y187系统
酵母菌株 Y1HGold Y187
基因型 MATα, ura3-52, his3-200, ade2-101, trp1-901, leu2-3, 112, gal4Δ, gal80Δ, met–, MEL1 MATα, ura3-52, his3-200, ade2-101, trp1-901, leu2-3, 112, gal4Δ, gal80Δ, met–, MEL1 URA3 : : GAL1UAS-GAL1TATA-LacZ
诱饵载体 pAbAi
pHIS2
报告基因 抗性报告基因AUR1-C 营养报告基因HIS3
AbA抑制酵母中AUR1基因编码的肌醇磷脂酰胺合成酶的活性,突变基因AUR1-C的表达使转化酵母对AbA产生了抗性。低浓度的AbA就能杀死敏感的酵母菌株,能大大消除筛库时的背景克隆,降低假阳性;
3-AT是酵母His3p基因的竞争性抑制剂,它只能延缓菌株生长速度,不如AbA的作用直接,经过一段时间培养,非目的菌株也有可能在筛选板上生长,筛库时产生假阳性的概率相对较高。
获得诱饵菌株方式 诱饵质粒线性化后整合到Y1HGold基因组中 诱饵质粒直接转入Y187细胞
线性化诱饵质粒整合到酵母基因组中能产生稳定的酵母报告菌株,其中每个细胞只有一个报告基因拷贝,从而控制背景表达水平。但这种方式比直接转化耗时久,因为要通过PCR扩增及测序鉴定诱饵是否正确整合到酵母基因组中去。
筛库方式 文库质粒转入诱饵酵母菌株中 文库质粒转入诱饵酵母菌株中或文库质粒与诱饵质粒共转酵母菌株
两种转化方式并不会对结果造成太大差异,前者使用质粒的量较少,后者操作简便耗时短