DAP-seq技术服务

DAP-seq技术服务

传统的ChIP-seq 是进行体内检测 TFBS 的主要方法,繁琐步骤和材料需求阻拦了很多科研进程。 DNA亲和纯化测序方法,成功将体内结合实验转移到体外,解决了ChIP抗体制备的困扰,极大的提高 DNA Binding Site发现的效率。 DAP-seq不仅能够超高通量查找TFBS,还能深入了解众多TF的生物学特性和结合位点结构,在任何有机体的顺反和表观研究中表现出巨大的价值。 具体方法为:通过体外蛋白表达技术,表达出带有标签的转录因子,和基因组 DNA 文库在体外进行结合,然后分离出所有与转录因子结合的 DNA,再使用高通量测序,找到转录因子的结合位点。

实验流程
DAP-seq技术服务实验流程



ChIP-seq DAP-seq
其一:转录因子(TF) 表达量低,非模式植物转基因材料难获得。 解决方案:无细胞蛋白表达系统。
其二:需要的抗体周期长、费用高、质量不稳定。 解决方案:无需抗体。
其三:文章难高分。 解决方案:抢占新技术风口,《CELL》 已有20分文章发表。

服务列表
服务项目 周期 交付材料
A、转录因子表达载体构建 2~3周 1、质粒冻干粉2ug
2、包含质粒的克隆菌株(甘油菌)1ml
3、载体构建COA文件
B、转录因子蛋白无细胞表达 1~2周 4、无细胞蛋白表达实验报告
5、WB检测报告
C、DAP-seq 文库构建 1~2周 6、文库构建实验报告
D、DNA亲和纯化 2周 7、亲和纯化实验报告
E、illumina二代测序 2周 8、原始数据
F、数据处理及分析 2周 9、MEME数据分析
10、转录因子结合motif序列推论